作为男子性高潮的射精过程，需要在腰骶部脊髓内射精中枢神经支配下，附睾、输精管、精囊腺、前列腺等器官的肌肉发生节分律性收缩把精液排入尿道，再由阴茎、会阴部的肌肉有节律地收缩，将精液排出。负责支配收缩的神经会释放去甲肾上腺素刺激这些器官的肌肉收缩。正常射精活动不仅不会出现疼痛感，相反还具有欣快感。但是，如果上述部位的任何一部分发生器质性变化都会引起射精疼痛。除了各种客观因素之外，还有一些精神必理因素也可造成性交疼痛。因此射精疼痛就成为一类病因复杂而且无法一一明确分类的精神心理因素与器质性因素相混合的症候群，它表现为射精时发生在阴茎、尿道、会阴或下腹部等部位的局部灼痛、牵引痛和剧痛。这类性交中或性交后的疼痛刺激常导致男子在性生活时精神不能集中，甚至无法进行正常性交。
很多男子主诉在射精后阴茎龟头极度敏感，它不能耐受抚摸或在阴道内继续抽动等任何形式的进一步刺激，龟头的这种超敏感觉是生理性的。男子这种感觉的个体差异很大，个人的耐受程度也不同，有些人只有受到过于激烈或过度刺激时才引起超敏感觉。
引起射精疼痛的器质性问题包括：后尿道炎、阴茎血栓性静脉炎、淋病、前列腺炎或精囊炎等。当病人主诉射精时出现灼痛应尽快给予彻底治疗。
老年人在射精最初阶段可出现前列腺痉挛性反应。这种痉挛性收缩可引起小腹的明显疼痛，并向大腿内侧或膀胱放射，有时还能放射到直肠及其周围部位一。这种病理性的挛缩可通过给予汴剂量的睾酮替代疗法得到有效的治疗。
至于能引起射精疼痛的心理因素与早泄、不射精等病症中所介绍的相似，心理性射精疼痛只是种种心理障碍对性功能产生的不良影响之一，这里就不再赘述。
